庚文君原籍颍川鄢陵（今河南鄢陵西北）人，父亲庚琛所以庾文君从小与哥哥庾亮跟着父亲在会稽居住。她长得很美，才情俱佳的女子。
司马睿久慕庾亮之名，将他召人建康。司马睿听说庚亮有个妹妹庾文君，便做主替儿子司马绍纳聘为妇。司马绍是司马睿的长子，在司马睿即位之初，于大兴元年（318）就被立为皇太子，由司马睿做主把庾文君纳为司马绍之妻。庾文君嫁给皇太子司马绍后，她善良贤淑，对司马绍十分尊敬，受到庾文君的宠爱。
永昌元年（322），手握重兵的荆州刺史王敦起兵谋反。王敦与其堂弟王导是拥立晋元帝的功臣，把持朝中大权。晋元帝为抑制王氏，削弱王氏的势力，重用刁协、刘隗等人。这一年王敦就以“清君侧”为名，起兵直捣建康，很快攻进石头城，进逼宫阙。晋元帝束手无策，太子司马绍再也不能忍耐了，决心拼一死战。
这天，司马绍穿上战袍，带领数百名禁军登上战车，出官亲自督战。温峤闻声赶来，拦住司马绍劝道：“殿下乃国家储君，怎能轻易冒死出战，自弃社稷？”司马绍不听，拍马继续要走，温峤抽出宝剑砍断了缰绳，死死拉住不放，太子只得下马。宫中的卫士几乎逃光了，只剩下几名宦官陪着晋元帝。元帝此时已脱去战袍，换上了朝服，自言自语地说：“王敦）着想据此宝卒，何不早说，为何要如此害民？”想了一会，派出使者晓谕王敦说“如肯歇兵，我当回琅琊，让位于卿。”但王敦不听，仍挥兵前进。王敦占领建康城后，刁协、刘隗等人死的死、逃的逃，晋元帝已完全变成了傀儡，受掣于王敦。王敦多次提出让元帝废掉司马绍，另立幼子为太子，目的是他可专权擅政。但大臣们一致反对，说太子、孝仁，并无错处。王敦只得作罢。晋元帝司马睿只能眼睁睁地看着王敦一伙飞扬跋扈，逼辱朝廷，遂即忧愤成疾，卧床不起。然而，元帝最放心不下的仍是太子，见大臣无一人可托，不得已召人司空王导，托他辅佐太子登位。嚼咐之后，饮恨而死，年47岁。司马绍即位，为晋明帝。第二年，册立太子妃庾文君为皇后，立庚氏所生长子司马衍为皇太子。
司马绍登基的第二年，乘王敦病危之机，命温峤领兵讨代，一举击溃了王敦，重新稳定了朝廷。可惜明帝司马绍只作了三年皇帝，年仅27岁病故。临死前命庚亮为中书令，辅助太子。年仅5岁的小太子司马衍登上皇位，史称晋成帝。皇帝幼小，不能亲政，大臣们集体上表请庾皇后以太后的身份临朝。于是，明帝尊母为皇太后，垂帘听政，又命王导参录尚书令，与中书令庚亮一起辅政。庚太后再三辞让不，只得答应。王导因王敦的缘故，万事皆请庚亮做主，庾太后也倚重自己的哥哥。于是，内外大权都掌于庚亮一人之手，庚文君太后并不参与国家大事，只在后宫平静度日。
庾文君是江南名士庾亮的妹妹，因兄长之美名，使得恶元帝司马睿选为儿媳，入宫之后，夫妇恩爱，然而司马绍早亡。被尊为太后，儿子尚小，只好垂帘听政，一弱女子只得任用其兄长，结果选成外戚专权，把握政纲，引起兵变，对东晋的政权起了重大的影响。
庚亮当政后，一面排斥王导，一面又疑忌盘踞长江上游、握有重兵的荆州刺史陶侃以及历阳镇将苏峻等人，导致苏峻叛变。成和六年（331）苏峻率部攻进建康，纵兵闯入宫廷烧杀抢掠。庚年仅三十二岁的庾文君不忍受苏峻逼迫、忧慎而死。