孝惠章皇后，为顺治帝的第二任皇后，科尔沁贝勒绰尔济之女，博尔济吉特氏。清崇德六年，即公元1641年，生于科尔沁大草原。孝惠章皇后是世祖废后的侄女，孝庄文皇后的儿媳。清初之时，为了满蒙之间稳固的关系，顺治帝的后宫大部分都是蒙古族的女子，更不用说皇后了。不管是对于科尔沁来说，还是对大清来说，那个时候的皇后只能是科尔沁的姑娘。所以在第一位科尔沁姑娘被废之后，尽管顺治帝已经厌烦了蒙古族的姑娘。被孝庄太后和诸大臣还是坚持从科尔沁重新选了一个女子为后，这第二任皇后就是孝惠章皇后，博尔济吉特氏。
公元1654年，按旧历为清顺治十一年，这一年博尔济吉特氏辞别父母，告别草原自由的生活，带着全族人的祝福，从千里迢迢的蒙古赶往京城。五月，选满珠习礼孙入宫，初封为妃；六月，册为皇后。
博尔济吉特氏，虽然贵为皇后，身后还有孝庄太后支持，但是还是一直不得顺治喜爱。帝后不慕，世所皆知。这段时间还好，只是厌烦。等到清顺治十三年之后，顺治帝对她就不只是厌烦，可能就要变成厌恶了。因为在这一年，让顺治帝爱的死去活来的董鄂妃进宫了。董鄂妃的大名，相信大家都是听过的。这位姑娘，入宫之后，晋位迅速，夺去了顺治帝全部的宠爱。就连顺治帝的死亡之谜，都与她有关。有人说顺治帝因为董鄂妃的死亡，心神俱碎，拖垮了身体。也有人说，董鄂妃的死亡，让顺治帝对江山，对红尘都失去了兴趣，因此虽然没有死，却遁入了空门。无论是哪一种说法，都体现了董鄂妃对顺治帝的重要性。
那么董鄂妃的入宫，如何给博尔济吉特氏造成影响呢？原因无它，自然是因为博尔济吉特氏占据了皇后的位份，而这个皇后之位，在顺治看来，应该属于董鄂氏。十三年八月，内大臣鄂硕女董鄂氏入宫，册为贤妃；十二月，晋董鄂贤妃为皇贵妃。皇贵妃之上，只有一个皇后。一人之下，万人之上，尊贵无比。但是在顺治帝看来，这还不够，他想让自己心爱的女人，成为这个国家最尊贵的女人。可是上面已经有了一位蒙古族的皇后，就算他想要册封董鄂氏为后，也不能成行，所以到了后来顺治帝可以说是想方设法的想要废掉她。
清顺治十五年的时候，孝庄皇太后身子不适，顺治帝虽然忧心母亲的身体，但另一反面他也觉得这是一个很好的机会。什么机会？当然是废掉博尔济吉特氏的机会。“十五年正月，因太后不豫，世祖责后礼节疏阙，停用中宫笺表，下诸王大臣议论废后事宜”顺治帝这一做法，当然瞒不过精明的孝庄，“知子莫若母”她很清楚顺治的最终目的。所以立马下旨，这才保住了博尔济吉特氏的皇后之位。
“十七年八月，董鄂妃病故，追尊孝献皇后；十八年，世祖崩。皇三子玄烨登基，是为康熙帝，尊后为母后皇太后，上尊号曰仁宪皇太后，居慈仁宫，后有抚康熙第五子胤祺于宫。康熙二年，康熙帝生母慈和皇太后崩；康熙二十六年，昭圣太皇太后崩。”康熙生母和孝庄先后去世，只留康熙和博尔济吉特氏。康熙是个孝顺的帝王，在共同经历了孝庄太后的去世后，晨昏定省，时刻问候，母子感情更进一步。
康熙五十六年，博尔济吉特氏逝世，享年77岁。据说孝惠章皇后博尔济吉特氏重病之时，尽管康熙因为废太子之事，心力交瘁，头眩足肿不能行，仍以帕裹足至宁寿宫亲奉汤药，太后昏迷之际，康熙帝跪于床下，捧太后手呼曰“母后，臣在此”，太后闻言，张目而视，不能语，执帝手视之；丙戌，太后崩，康熙号恸欲绝，坚行割辫之礼。“割辫之礼”，仅在孝庄去世时，康熙才做过，可见康熙与嫡母之间深厚的感情。
孝惠章皇后博尔济吉特氏去世之后，被葬在清东陵之孝陵之东，经历代累加谥后，谥号为“孝惠仁宪端懿慈淑恭安纯德顺天翼圣章皇后”