武德元年（618年），李渊称帝，拜李孝恭为左光禄大夫，不久改为山南招尉大使，负责经略巴蜀，攻占三十余州，俘获朱粲。武德二年（619年），任信州总管，献计并率军攻打南方的萧铣，立下战功。武德三年（620年），封赵郡王。武德四年（621年），李孝恭任夔州总管，大造战舰，练习水军，李靖为副将，灭萧铣，受封荆州大总管，成功招抚岭南诸州。武德六年（623年），又率军攻打辅公祏，用一年时间将江南平定，因功拜扬州大都督，之后因被人告发谋反而免官改任宗正卿，又历任凉州都督、晋州刺史。武德九年（626年），赐实封一千二百户。太宗李世民即位后升任礼部尚书，改封河间郡王。贞观初，任礼部尚书，以功封河间郡王，好游宴，晚年以歌舞美人自娱。
贞观十四年（640年），暴病身亡，年五十岁。诏赠司空、扬州都督，陪葬献陵，谥元，配享高祖庙庭。列为凌烟阁二十四功臣之一。
人物生平
攻略巴蜀
李孝恭的祖父李蔚，就是唐国公李虎的第七个儿子（李世民的祖父李昺是李虎第三子）。隋朝末年，李渊在晋阳起兵，攻克长安后，下诏拜他为山南道招慰大使，领兵出巡巴蜀地区，连下三十余州。随后进击朱粲。大破其阵，俘获其众，诸将都说：“朱粲之徒杀食活人，是凶恶之贼，请将他们坑杀。”孝恭说：“不能这样。如今列城尽在寇境，如获敌则杀，以后还有谁归降呢？”全都赦罪释放。由此缘故，传檄所至之处，相继归附。
武德二年（619年），李孝恭被封为信州总管，承受制命可以权益授官。
平灭萧铣
李孝恭尽召巴蜀地区首领子弟收录任用，对外表示引荐擢用，而内心是将他们作为人质。
武德四年（公元621年），李孝恭被任命为荆湘道行军总管，统率水陆十二支军队从夷陵出发，击破荆门、宜都二镇之兵。
这时，萧铣的骁将文士弘率数万精兵驻守在附近的清江。李孝恭大兵一到，即想进击。李靖劝告他说：“文士弘，是萧铣的健将，士卒精锐骁勇，现在荆门刚刚失守，他把精锐兵力全都派出来迎战，这是救败的军队，恐怕锐不可挡。我们应当暂且把战船停泊在长江南岸，不与敌人交锋，等到他们士气衰落，然后出击决战，一定能攻破敌军。”李靖的避其兵锋，挫其锐气，然后一战可擒的战术是很正确的，但李孝恭由于连战告捷，错误地估计了敌人的力量，没有听从他的劝告，遂命李靖留守军营，自己率兵出战。果然不出李靖所料，双方一交战，孝恭军大败，即逃奔南岸，损失很大。文士弘获胜以后，即纵兵四出抢掠，兵士肩扛手提，多有收获。李靖见敌军队伍大乱，遂不失时机，迅即指挥唐军出战。文士弘军一时难以收拢，措手不及，结果被唐军打得落花流水，被杀及溺水而死者将近一万人，获得舟舰四百余艘。
攻下夷陵之后，李靖又马不停蹄，率轻骑五千为先锋，直奔南梁都城江陵，李孝恭率大军继后。李孝恭带领大军继续进攻，李靖又击败萧铣的骁勇大将杨君茂、郑文秀，俘获士卒四千多人，攻克江陵外城，接着又占领水城，缴获了大批舟舰，解开战舰放于江中。诸将说：“所获船舰应当为我军所用，弃船就会资助贼寇，这样做是为了什么呢？”孝恭说：“萧铣的辖境，南至岭表，东达洞庭，地势险要战士众多，如今萧铣沿江镇守将士众多，如城未攻下而援兵到来，我军就会内外交困，舟船虽多，又有何用？如今萧铣已败，不会马上进兵，往返打听情况，就可延缓其救兵，那么我军就能顺利地攻下江陵了。”不久萧铣救兵到达巴陵，见空船，果然迟疑不进。
萧铣自度救兵难于急至，就对属下说：“天不助梁，数次亡国。如果战至力屈而降，唐军必因军士死伤而大杀城内百姓。怎能因为一人之故而使百姓遭殃呢。现在城池还未被攻拨，我先出降，可能会保全民众。众人失我，何患无君！”于是他亲自巡城下令投降，守城军士都号哭不已。萧铣祭拜太庙后，率官吏赴李孝军门请降：“当死者惟有我萧铣，百姓无罪，请勿杀掠。”李孝恭把萧铣用囚车送至京师。
俘辅公祏
李孝恭平灭萧铣后，被拜为荆州大总管，岭南四十九州皆望风而降，李渊大喜，任命他为荆州大总管，下诏画工图其击破萧铣之状以呈进朝廷。
李孝恭治理荆州有方，大力开置屯田，创设铜冶，以便利百姓。不久迁任襄州道行台左仆射。那时岭表地区还未平定，他便分别派遣使者抚慰，其投诚归附者有四十九州，使朝廷号令畅通于南海之滨。
武德六年（623年），杜伏威的部将辅公祏反唐、杀王雄诞、率部占湖州。孝恭率兵前往九江，李靖、李勣、黄君汉、张镇州、卢祖尚全都受他指挥。出发之前，大飨将士，杯中之水忽变为血，在座者脸色尽变，孝恭举止自如，从容不迫地开导说：“祸福无门，惟人所招！我没做什么负心事，诸位不必为我如此忧心。辅公祏恶贯满盈，如今依仗朝廷威灵以问罪致讨，杯中之血，乃是贼臣授首的征兆而已！”一口饮尽，众心遂安。辅公祏部将冯惠亮等人守险邀战，孝恭坚守壁垒而不出战，派出奇兵断绝贼寇粮道，贼众渐饥，夜逼其营挑战，孝恭坚卧不动。第二天，派出羸弱兵卒前往贼营挑战，令卢祖尚挑选精骑严阵以待。不一会儿羸兵退却，贼寇追击败卒甚为嚣张，与祖尚之军相遇，交战一场，大败其众。冯惠亮退守梁山，孝恭乘胜攻破梁山别镇，贼众赴水死者数以千计。
武德七年三月二十八日（624年4月21日），辅公祏穷蹙，放弃丹阳逃走，孝恭派出骑兵穷追，俘获辅公祏于武康。 二十九日，李孝恭杀越州都督阚棱，江南平定。 拜扬州大都督，江淮及岭南诸州都归他所统摄。隋灭乱起，李氏家族除李世民带兵纵横天下外，宗室中只有李孝恭一人能独当一面，并立有大功。孝恭两次击破大寇，北起淮河，东包长江，越岭而南，尽归他统管。因而想以威名夸示远俗，便修筑宅第于石头城中，设立哨所往来巡察以护卫自己。 有人诬告他谋反，因此被召还京师，颇受有关部门追究盘问，既无证据，便被赦免为宗正卿。赐予实封一千二百户。历任凉州都督、晋州刺史。贞观初年，迁任礼部尚书，改封为河间郡王。
晚年生活
孝恭性情奢侈豪爽，后房歌姬舞女达一百余人，然而待人宽恕谦让，没有骄矜自得之色，故而李渊、李世民都对他十分亲待。功成名就之后，这位王爷不喜反悲，对左右说：“我住的大宅子真是太宏丽了些，应该卖掉再买座小院子，能住就可以了。我死之后，诸子有才，守此足矣。如果这些犬子不才，也免得这么好的大宅子便宜了别人。”
贞观十四年（640年），李孝恭得急病一下死掉，时年才五十岁，正当壮年。李世民亲自举哀，哭之甚恸，赠司空、扬州都督，陪葬献陵，谥曰元，配享高祖庙庭。
家族成员
长辈
父亲：李安，字符德，隋右领军大将军、赵郡怀公。唐朝追赠为西平怀王。
兄弟
长兄：李琛，襄武郡王，武德三年（620年）薨。
弟弟： 李瑊，济北郡王。卒于始州刺史。
李瑰，武德元年（618年）封汉阳郡公，五年（622年）进爵为汉阳郡王。太宗即位，降爵为公。贞观四年（630年），拜宜州刺史，加散骑常侍。
子孙
长子：李崇义，袭河间郡王，后降爵为谯国公，历任蒲、同二州刺史，益州大都督长史，甚有威名。后卒于宗正卿。
孙：李尚旦，益州大都督参军，为酷吏所杀。 曾孙：李仙鹤，汲郡司功
曾孙：李仙芝，金坛令
曾孙：李仙童，左千牛中郎将
孙：李尚道
曾孙：李汪
玄孙：李耸
来孙：李鼎，朝散大夫、临晋县令、上柱国
次子：李晦（《新唐书·宗室世系表》作李崇晦），永昌元年（689年）卒，追赠幽州都督。
孙：李荣，李晦子，嗣吴王，为酷吏所杀。
三子：李崇真，官至岐州刺史。
人物评价
《旧唐书》：自大业末，群雄竞起，皆为太宗所平，谋臣猛将并在麾下，罕有别立勋庸者，唯孝恭著方面之功，声名甚盛。厚自崇重，欲以威名镇远，筑宅于石头，陈庐徼以自卫。
孝恭性奢豪，重游宴，歌姬舞女百有余人，然而宽恕退让，无骄矜自伐之色。太宗甚加亲待，诸宗室中莫与为比。
疏属尽封，启乱害公。河间孝恭，独称军功。
“河间节贯神明，志匡宗社，故妖不胜德明矣。道宗军谋武勇，好学下贤，于群从之中，称一时之杰。无忌、遂良衔不协之素，致千载之冤。永徽中，无忌、遂良忠而获罪，人皆哀之。殊不知诬陷刘洎、吴王恪于前，枉害道宗于后，天网不漏，不得其死也宜哉！”
《新唐书》：“景、元子孙，当草昧之初，乘运而奋，方高祖攘除四方，所以宣力，皆显显为世豪英。至河间之功，江夏之略，可谓宗室标的者也。”
《十七史百将传》；“李孝恭，少沉敏有识量。孙子曰：‘形之，敌必从之。’孝恭纵船江中以疑贼援。又曰：‘禁祥去疑。’孝恭以杯血为授首之祥，而众心安。又曰：‘以利动之，以卒待之。’孝恭使羸兵挑贼，而待以精骑是也。”
陈元靓：“唐室之隆，时推英宗。佐佑王业，缉熙帝功。擒萧定乱，戮辅英凶。锡祀河间，茂哉厥庸。”
黄道周：“孝恭唐族，智勇无双。行循巴蜀，降者相望。众请坑戮，孝恭酌量。获降则杀，谁肯复降。进围萧铣，铣镇破亡。获其战舰，尽放满江。救谓已破，不敢直当。既知再进，铣已降唐。辅公祏反，兵寇丹阳。孝恭往讨，酒浮血光。众惊恭喜，授首之祥。既而擒斩，河间封王。人虽暴戾，功实难忘。”
史书记载
后世地位
公元782年（建中三年），礼仪使颜真卿向唐德宗建议，追封古代名将六十四人，并为他们设庙享奠，当中就包括“唐司空河间郡王孝恭”。 及至公元1123年（宣和五年），宋室依照唐代惯例，为古代名将设庙，七十二位名将中亦包括李孝恭。 在北宋年间成书的《十七史百将传》中，李孝恭亦位列其中。
凌烟阁二十四功臣
这二十四位功臣是：司徒、赵国公长孙无忌、司空、扬州都督、河间元王李孝恭、司空、莱国成公杜如晦、司空、相州都督、太子太师、郑国文贞公魏徵、司空、梁国公房玄龄、开府仪同三司、尚书右仆射、申国公高士廉、开府仪同三司、鄂国公尉迟敬德、特进、卫国公李靖、特进、宋国公萧瑀、辅国大将军、扬州都督、褒忠壮公段志玄、辅国大将军、夔国公刘弘基、尚书左仆射、蒋忠公屈突通、陕东道行台右仆射、郧节公殷开山、荆州都督、谯襄公柴绍、荆州都督、邳襄公长孙顺德、洛州都督、郧国公张亮、光禄大夫、吏部尚书、潞国公侯君集、左骁卫大将军、郯襄公张公谨、左领军大将军、卢国公程知节、礼部尚书、永兴文懿公虞世南、户部尚书、渝襄公刘政会、光禄大夫、户部尚书、莒国公唐俭、光禄大夫、兵部尚书、英国公李勣和徐州都督、胡国公秦琼。