两晋南北朝时期的名医有晋代的王叔和、皇甫谧、葛洪和梁代的陶弘景。
王叔和是西晋太医令，他精通脉理，着《脉经》十卷，把脉象归纳为二十四种，奠定了脉学的理论基础。
皇甫谧长于针灸，着《针灸甲乙经》十二卷，是中国第一部针灸学专着。
葛洪着《肘后卒救方》三卷，记录了当时许多有效的药方。
萧梁时的陶弘景增补葛洪的《肘后卒救方》，着《肘后百一方》。他对汉代流传下来的《神农本草经》作了增补，整理成《本草经集注》。他首创按药物的自然属性和医疗属性的分类法，把七百多种药物分为七大类。这种分类法，后来成为中国古代药物的标准分类法，一直沿用和不断充实。
在洛阳龙门石窟，有一个药方洞，保存了南北朝时期大量的药方。药方洞，全洞深四点三米，宽三米，主像是一佛、二弟子、二菩萨、二力士、二狮子，为北齐时所造。
洞口过道两侧刊刻着一百四十个药方。在这些药方中，属于炙法的二十三方，药物治疗的一百一十七方。这些石刻药方记录了我国古代医药的成就。对于研究史有重要价值。药方中提到的病名，现能看清的有四十六种，如疟、反胃、漆疮、心疼、消渴、遍身生疱、五痔、丁疮、失音不语、温疫、癫狂、赤白痢、小便不通等。药方中提到一种疰病，就是结核病。古书中以“疰”的解释是“一人死，一人复得，气相灌注也”。“气相灌注”，实际是指病菌传染。药方中还有“灭瘢方”，瘢，是北齐时代对天花病的叫法。这些提到的病名涉及到内科、外科、妇科、小儿科以及五官科。
在用药方面，一百四十个药方中，除残缺过甚者外，现能看出用一种药物的四十三方，两种药物的二十九方，三种药物的十方，四种药物的五方。用一、二种药物的占百分之八十以上，而且所用药物都是农村生活中极易找到的。这些药方的制剂方法有丸、散、膏、汤等；用药方式有内服、外敷、洗、熏等，还有针炙和熏、洗并用的。这些石刻药方，反映了当时民间医药已经具有丰富的知识，说明了当时中国的医药技术已经具有相当水平。