对于失职、渎职，职务侵占的大臣，道光帝下令历任管库司员、查库御史人等着逐细查明，严行治罪。为了追缴库银，尽可能地减少国库损失，道光帝又下令：自嘉庆五年起至道光二十三年，历任库官、查库御史各按在任年月，每月罚赔银1200两，已故者照数减半;管库大臣着每月罚赔银500两，查库王大臣每次罚赔银6000两，已故各员按数减半。
在长达40多年的时间里，共有320余位官员出任户部司员或查库御史，任职时间在1年左右为最多。这些官员无论公忠廉能与否，一律进行追罚。
道光帝对银库案的处理态度坚决，就连最受他信任、亲近的高官也不能幸免。比如道光朝身任宰辅多年的三朝元老、大学士、军机大臣曹振镛，也因库案所涉，被减半罚赔银2万余两。其时人已去世，由其子照数赔补。其子赔补1万两后因病身亡，又改由其孙继续补缴。曹振镛如此，其他人不问可知。
骆秉章也无法幸免。他因查库一年有余，工作失察被先行革职，再被罚赔款12800两。一向清廉的骆大人去哪弄这么多钱交罚款呢？好在他的朋友圈给力。亲家伍承禧、门生吴廷溥、同乡梁铁山、宋萼楼等人纷纷出手相助，终于筹得如数款项交到户部。
前面提到的骆秉章的两位恩师，当朝权贵潘世恩和穆彰阿也各因查库两次失察双双被罚银12000两。
银库被盗大案给道光帝带来的重创不仅是钱财的损失，更多的是让他产生了严重的心理阴影，他开始对身边的王公大臣和满朝文武心灰意冷，对谁也不敢再相信。但思前想后，道光帝又有点不甘心，难道我大清官场到了一片漆黑的地步，在银库案中就没有一个清廉官员了吗？他抱着最后一丝希望和侥幸问左右，有没有哪位官员没有收过规银？结果得到回复，至今只有御史骆秉章非但“己身不染”，而且“仆隶亦不受丝毫”。听说还有一位廉吏，道光帝极为高兴，一直紧锁的眉头终于舒展开来，黑沉沉的脸也难得有了一丝笑容。
看到这里，大家可能不以为然，那骆大人深知银库之弊，既不能改陋规，建章立制;又不敢捅黑幕，向上举报，好像也算不得什么清官、好官。那我们听听心里很受伤很受伤的道光皇帝是如何说的吧。
道光二十三年（1843年）年底，骆秉章在被撤职后很快恢复工作，被任命为詹事府右春坊右庶子。此时，骆大人51岁，已过知命之年。
道光皇帝特地召见骆秉章，发表了一番通情达理、体恤入微、语重心长的谈话，文言译成白话，大约是如下几层意思――
你那年查库做得不错，不光是我知道，可以说满朝文武没有不知道的。你读过书，清廉二字是本分，你的品格还是读书人的品格。我知道你在银库当差想为国家出力，事事整顿。别人都愿意做的事，你不愿做。无奈是积重难返，靠你一个人哪能挽回？况且银库工作量之大，也不是你一人能够清盘核查的。可见当皇帝有皇帝的难处，当臣子有臣子的难处。
大家都知道银库亏空，但也没个准数，这种情况下，你如何敢向我奏明？即便王大臣、管库大臣知道银库亏损，但在未得准数情况下也不敢奏我的。如果你知道银库短缺900万两之多，你肯定没有不奏之理。可是即便奏了我，我就是将所有库官御史杀头的杀头，充军的充军，撤职的撤职，调动的调动也是于公事无济。
今日有此案，你的名声更大了，没有此案，我也不知道你，更不知道你内心到底想些什么，我现在赏你右庶子职务，这是读书人升职的必须途径，你不要看只是五品，你以前的府丞是四品，但也不过是四品，你好好做学问，好好做官，将来好为国家办事……
这是道光皇帝表明态度和立场的真心话，既有对骆在银库有所为的肯定和赞许，又有对骆有所不为的理解和包容，更多透露的信息则是将来要重用骆秉章。
“升封疆，其见知自此始”。国库被盗大案成就了骆秉章。在清廷上下官员大都非贪即占的一片浑浊中，他以廉洁奉公的良好品行进入了大清皇帝视野。此后他被派到山东、河南和江苏三省去做巡视大员，专门整肃官场风气。其后又出任湖北按察使、湖南巡抚和四川总督……官居一品，位极人臣，成就了他作为一名汉籍官员的辉煌。