萧拜住由于具有不凡的德才，入仕后迅速迁升，在元成宗时已被拜授同知大都路总管兼知中山府，政绩斐然，但同时为同僚妒忌。不久，因父死丁忧辞去官身，居家守孝。此时的仁宗尚为太子，恰途经中山，同僚自以为有机可乘，就对仁宗的近侍说： 知府大人在此时间离职，他是怕迎接圣上的烦劳啊。 仁宗听后点点头，心中很不高兴。恰行至田野，见一老妪，问之曰： 这里的官员哪一个最贤良？ 老人毫不犹豫地说： 只听说有个萧知府，其他人都不知道。 仁宗开始困惑起来，又路过一神祠，见数位老人在焚香膜拜，感到很奇怪，就派人过去问一下， 你们祈祷什么呢？ 众人一起回答说： 萧知府奔丧返家，我们想让他尽快回来，所以在这里祈祷上天。 仁宗心中疑惑立时如同冰释，他知道萧拜住是位难得之才，遂鼎力荐举复职。武宗即位后，把萧拜住拜为中书左司郎中，最后直升至御史中丞。
二、铁肩道义斗权奸
萧拜住在武宗时已仕至御史中丞，仁宗即位后，又历任陕西行省右丞、中书平章政事、中书左丞相。
元仁宗是位既 通晓儒术 ，又 妙悟释典 的有作为君主，他有一定的能力、才干。登基后，撤换旧臣，革除弊政；重视人才，首开科举，加强法纪，纂修《风宪纪纲》，大有振兴元朝的势头。但是仁宗为政，由于时时受到太后和右丞相铁木迭儿的严重干扰，皇权与后权之间的斗争也此起彼落，曲折剧烈。
太后答己早在武宗即位时已立为皇太后，武宗还特为她修筑了兴圣宫。答己聪慧精明，但不事检点，自当上太后后淫恣更甚，尤其拉拢铁木迭儿为奸，兴圣宫几乎成了凌驾于天子之上的又一朝廷。铁木迭儿是个品德极为恶劣之徒，官声极其狼狈，但深得太后信任和庇护。在武宗至大年间已为云南行省左丞相，武宗驾崩，答己即召之为中书右丞。仁宗虽早就厌恶铁木迭儿并且恨不得杀了他，但不敢违忏太后旨意，仍然惟太后之命是从，把铁木迭尔任命为相。铁木送儿居相位两年，后虽曾经为仁宗罢去，但在太后压力下，后又复居人相位，恃势贪虐，凶秽愈甚， 中外切齿，群臣不知所为 。
在这万般无奈之下，仁宗只能采取抑制铁木迭儿的办法，将萧拜住由御史中丞拜为中书右丞，又擢为平章政事副丞相，这样调整的目的是为了制约铁木迭儿等，对抗太后；萧拜住也心领神会，明白肩上的重担，遂慨然以纠正铁木迭儿之罪为己任。
萧拜位联络御史中丞杨朵儿只和贺伯颜，又联络了内外监察御史四十余人，共劾铁木迭儿 桀黠奸贪，阴贼险狠，蒙上罔下，经政害民，布置爪牙，威胁朝野，凡可以诬陷善人，要功利己者，靡所不至 。
章奏列举事实，证据确凿，无可指摘。仁宗闻奏大怒，立即下诏逮问。铁木迭儿异常狡猾，迅速逃匿于太后宫中，刑掌官员未能捕得，仁宗心中很不痛快，好几天不肯喝酒，以示惩奸的决心。但因太后的庇护，结果还是一样，最后人总只能诛掉铁木迭儿家奴及其同恶者数人而已。
御史杨朵儿只极为愤恨，上书坚决要求严惩铁木迭儿，将其斩首以谢天下。但杨朵儿只却被太后近臣召王宫门，责以违抗太后旨意。杨朵儿只凛然正气，厉声斥丽道： 我身为御史，奉行祖宗之法，必得罪人，非敢违太后旨意。 因有太后出面庇护，而仁宗仁孝，担心严惩铁木迭儿会使太后不高兴，便仅夺铁木迭儿印绶，罢其相位而已。不久，杨朵儿只升为集贤学士，萧拜住也被另迁为其他职官。
不久铁木迭儿又重新上台，以太子太师的身份出现，权势更加炙手可热，中外闻之，莫不惊骇。但仁宗也很无奈，无力扭转这种局面，于是萧拜住的处境也日趋险恶。
三、身被枉杀终见日
当仁宗驾崩后，答己太后就直接控制朝政，本来按照武、仁二宗的原约， 兄终弟及，叔侄相承 ，即武宗死后，仁宗即位，仁宗死后，武宗之子继位，但仁宗即位之后，违背誓约，打算使自己的儿子继位，答己也认为仁宗子年幼无知，易于控制，便赞同仁宗的主张。铁木迭儿嗅觉特别灵敏，附和太后主张，这样，仁宗、答己、铁木迭儿很快意见一致，十三岁的仁宗之子硕德人刺被立为大子。
仁宗死后，太子未能及时登基，皇权由太后把持着，屡遭大臣弹劾的铁木迭儿又在太后的支持下再任中书右丞相，他更为恃宠专权，变本加厉，大行报复，政治气氛格外紧张，腐朽统治更为黑暗。而杨朵儿只、萧拜住因为曾牵制其所为，揭发其奸贱不法等事，也就首当其害了。
一天，萧拜住与杨朵儿只忽接太后之旨，被召至徽政院问事，萧拜住明白，此行凶多吉少，并不感到突兀、他俩从容不迫，胸怀坦荡赴院答问。萧拜住与杨朵儿只刚踏进设政院，便发觉戒备森严、气氛凝重。徽政院俨然成了鞫审重囚的刑部大堂。铁木迭儿及其麾下徽政使失三门、御史大夫秃忒哈等人见到了萧、杨，不禁得意的奸笑起来，劈头究问萧拜住与杨朵儿只为何违抗太后的旨意。杨朵儿只怒不可遏，怒斥道： 吾任中丞之职，恨不即斩汝，以谢天下，果违太后旨，汝岂有今日耶！ 铁木迭儿无言以对，唆使御史二人，罗织罪名将两人下狱。
铁木迭儿马上向英宗秉奏，请依皇太后旨杀此二臣，英家虽然年轻，但并不懦弱，严词斥道： 人命至重，刑杀非轻，不宜仓卒，一人罪状未明，当白太后，使详谳之，若果无冤，诛之来晚。 但是，铁木迭儿假传旨还是向萧、杨二人挥起了屠刀。别人敢怒而不敢言，道路以目。萧拜住、杨朵儿只被押至国门之外就匆促杀害了。及后二人家产被籍没，天下人都感到冤枉，但是，太后和权臣一手遮天，在这个元朝统治极其黑暗的岁月，萧、杨等人的冤屈只能是石沉大海。
仁宗驾崩后两个月，英宗称帝，英宗自幼深受其父影响，熟读儒家经典，很有志向和才能。对萧、杨冤案早已有自己的看法。英宗即位两个月后，终于对太后党徒进行了大规模的清洗，使之 势焰顿息 。同时，起用 蒙古儒者 拜住为丞相，限制铁木迭儿的权力。至治二年八月，铁木迭儿渐见疏远，因为担心忧虑积久成疾死于家中。九月太后也以病亡。
但萧、杨等冤案平反尚未及执行，不久铁木迭儿义子铁失发动南坡之变，英宗、拜住被杀。继位者是晋王孙铁木儿，这就是泰定帝，他执政后清洗了铁失党徒，继续致力于冤案的平反昭雪，萧拜住被赠守正佐治功臣、太保、仪同三司、柱国，追封蓟国公。萧、杨二人冤案终于获得平反昭雪，魂见天日。