朱治早年曾担任县吏，后被察举为孝廉，州里辟其为从事，随孙坚到处征战。中平五年（188年），拜为司马，随军讨伐长沙、零陵、桂阳等三郡的周朝、苏马等贼军，立有战功，孙坚表他行都尉。初平二年（191年），关东联军讨伐董卓，朱治随孙坚大破董卓于阳人，进入洛阳，被表行督军校尉，特许将领步骑，往徐州帮助陶谦讨伐黄巾军。
从平江东同年，孙坚战死，朱治便辅助孙策，依靠于袁术。后来知道袁术不立政务、品德，便劝孙策返回江东自立。
朱治太傅马日在寿春，辟朱治为掾属，升为吴郡都尉。当时吴景在丹杨任官，而孙策受命为袁术攻打庐江，刘繇深怕为袁术、孙策所吞并，产生误解、猜疑。但孙策的家人都在州中，于是，朱治派人到曲阿迎接孙策母亲及孙权等幼弟，提供养护，对孙家甚有恩惠。兴平二年（195年），朱治从钱唐想进至吴，吴郡太守许贡在由拳抵抗他，两军发生战斗，大败许军。许贡南逃投靠山贼严白虎，朱治遂进入吴郡，代领太守事务。孙策成功平定江东。建安二年（197年），朱治举孙权为孝廉。
转战江南建安五年（200年），孙策被许贡门客所伤，不治身亡。朱治与张昭、周瑜等继续帮助孙权。建安七年（202年），孙权表朱治为吴郡太守，行扶义将军，以割娄、由拳、无锡、毗陵为食邑，设置长吏。后参与征讨夷越，平定东南，擒获黄巾余军陈败、万秉等。建安十三年（208年），曹操占领荆州，威震南土，孙权之堂兄、曹操的亲家孙贲畏惧，欲送儿子到曹军处为人质。朱治听到后，向孙贲陈说安危，孙贲便不送子质。孙权视他为上将，后孙权为吴王，朱治每次进见，孙权都会亲自迎接，以厚礼待他，设宴、赠予，恩泽、敬意特别多，而朱治的随从甚至也有礼物。
晚年生涯黄武元年（222年），朱治被封为毗陵侯。黄武二年（223年），拜为安国将军，授与金印、紫绶，徙封邑到故鄣。孙权常赞叹朱治忧心、勤于王事，令其担任督军御史典属城文书，不过，朱治只愿意接受领四县的租税。但当地子弟及吴四大姓家族多到郡出仕，郡吏常常以千计，朱治统辖了数年，全部遣到王府，每次都有数百人。每年进献，孙权都答报过厚。而当时丹杨深地，叛乱频频发生，而朱治仍觉年事而高，思恋故乡，自表到故鄣屯兵，镇抚山越。郡中的长老、朋友都到朱治家拜访，朱治任都引见，与他们共饮欢宴，乡党的人都引以为荣。在故鄣留了数年，返回吴郡，住了三十一年。黄武三年（224年），朱治逝世，享年六十九岁。据清乾隆《安吉州志》载，墓在顺安乡姚坞（今三官乡）。
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